学院现设有2个管理部门即学院办公室、学生工作办公室；6个学系即流行病与卫生统计学系、营养与食品卫生学系、劳动卫生与环境卫生学系、儿少卫生与妇幼保健学系、卫生毒理与卫生检验检疫学系、卫生管理学系；1个教研室即数学教研室；1个预防医学实验教学中心；5个临床教学医院和7个专业实习基地。